孕早期，胚胎内部可能会出现许多问题，其中最常见的因素是胚胎本身的问题。胚胎染色体异常是导致早期胚胎停止发育的最常见原因，占比高达50~60%。除此之外，感染和药物等因素也会导致胚胎自身发育异常。母体的健康情况，如全身性疾病、感染、高热、严重贫血、心脏病、肝肾功能障碍等，都可能导致胚胎停止发育。生殖器官的异常，如子宫畸形、纵隔子宫、双子宫、单角子宫、子宫肌瘤、宫腔黏连等，都可能影响胚胎着床，从而导致胚胎停止发育。此外，孕期中不良的习惯，如抽烟、喝酒、吸毒等，也可能导致胚胎停止发育。父亲的染色体异常也可能对胚胎产生影响。